学术分享

我们非常重视您的个人隐私,当您访问我们的网站时,请同意使用所有的cookie。如果您想详细的了解我们如何使用cookie,请访问我们的 隐私政策.

【干货分享】第二期:颜色补偿那些事儿

多重荧光PCR已经广泛地使用在各种病原体的检测中,这得益于荧光PCR检测仪多通道荧光采集的功能。

2022-01-20

多重荧光PCR已经广泛地使用在各种病原体的检测中,这得益于荧光PCR检测仪多通道荧光采集的功能。在使用罗氏480(LC1/LC2/Z cobas)进行多重检测时,往往会遇到需要做颜色补偿的情况,那么今天小编就与您聊一聊关于颜色补偿的那些事儿~

为什么罗氏480需要做颜色补偿?

首先,我们来看一下罗氏480的激发波长及检测波长
LightCycler1的滤光片:

图片.png

LightCycler2的滤光片:

图片.png

荧光通道发射光谱抛物线示意图:

图片.png

从上图可以看出在一个多色反应中,由于各染料的发射光的波长有重叠,导致一个通道能够捕获到另一个通道所检测的染料信号。这种荧光信号的溢出会导致无效的数据产生,即我们常说的“串色”或“串孔”现象。

由于每台仪器的滤光片是固定的,无法改变其激发光与检测光波长;想要校正这种溢出,在运行这个实验或分析这个数据时,就需要应用颜色补偿目标。当用颜色补偿目标时,LightCycler 算法会使用补偿实验文件中的数据来补偿荧光值的溢出,补偿后即可以看到每个通道特定的信号。


什么时候要做颜色补偿?
只有当多个荧光通道(比如VIC和ROX同时使用)用于数据分析时才有必要采用颜色补偿,当使用单通道时无需采用颜色补偿。
另外,由于合成的探针的荧光染料各个厂家之间存在一定的差异性,因此,不同厂家之间的颜色补偿数据一般不通用。在更换检测试剂盒时,需要进行对应厂家试剂的颜色补偿实验哦~

如何使用颜色补偿?

首先,按颜色补偿说明书进行颜色补偿实验
其次,进行常规的检测实验
最后,在每次检测完毕的分析界面调用补偿数据,具体操作如下:
A. 点击Color Comp 旁下拉菜单

图片.png

B. 选择In Database

图片.png

C. 选择补偿实验数据

图片.png

D. 最后重新计算即可
E. 补偿前后结果对比:

图片.png

补偿前

 图片.png

补偿后

从补偿前后结果来看,即可确定VIC通道中的翘尾,是ROX通道串孔所致。罗氏480分析界面调用补偿文件的方法也是一键操作,十分简便。针对一个厂家的试剂,颜色补偿实验只需做一次,数据便可一直使用。