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耀杰不凡丨第二刊：“肛拭子”频频上热门？伯杰医疗邀你一起知其所以然

近日，采集“肛拭子样本”用于新冠筛查的新闻成为大家热议的焦点，事件的起因是1月20日

2022-02-21

“耀杰不凡”致敬幕后抗疫英雄推文解读活动

第二刊：“肛拭子”频频上热门？伯杰医疗邀你一起知其所以然

近日，采集“肛拭子样本”用于新冠筛查的新闻成为大家热议的焦点，事件的起因是1月20日，北京新冠防控新闻发布会介绍，其已对大兴某新发病例所在学校全体学生、教职工等全部进行鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子及血清检测。

那么问题来了，此次北京大兴为什么在筛查中增加了“肛拭子”检测？其实，有关样本类型检出率这一议题，早先便有众多学者对其进行过讨论。2020年8月公布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第八版)》中也明确表示，可以在粪便、尿液中可分离到新冠病毒。

今天，笔者就带大家一同解析来自深圳市第三人民医院的刘映霞教授、刘磊教授与来自中科院深圳先进技术研究院的李亮教授团队的对该议题产生的探讨。深圳三院在疫情期间，第一时间“全员动员、全域作战”，在深圳抗疫的战场中全力投入，更是首次在全国率先从确诊患者粪便中检测出新冠病毒核酸阳性。

本期研究主题：新冠肺炎患者肠道排毒特征规律及不同标本病毒脱落情况研究

鼻咽拭子、口咽拭子、痰液、支气管灌洗液及肛拭子这些不同类型的标本与检测结果之间到底存在着什么样的联系呢？不同的病程进展情况下，上述各样本类型是否存在检出差异？且听大咖见解，一一道来~

解读文献1：《The Time Sequences of Oral and Fecal Viral Shedding of Coronavirus Disease 2019(COVID-19) Patients》

本研究成果由深圳市第三人民医院的刘映霞教授、刘磊教授和中科院深圳先进技术研究院的李亮教授团队在2020年5月16日发表于胃肠病学和肝病专业领域国际排名第一的医学杂志《胃肠病学（Gastroenterology）》，研究主题为新冠肺炎患者的肠道排毒特征及规律。

本研究持续对深圳三院住院的401名实验室确诊的COVID-19患者粪便及呼吸道样本中的病毒核酸进行监测，跟踪随访长达三个月以上，研究发现此次SARS-CoV-2在感染早期（病程第1周）从肠道排出的阳性率最高（44.19%），而2003年的SARS病毒在肠道的检出率通常需要在2~3周时才能达到高峰。随着病程进展，SARS-CoV-2在粪便中病毒核酸的阳性率逐步下降，在病程的4~5周形成一个平台期。通过对患者的临床资料分析，在病程的3~5周时，大部分患者临床症状已消失，各项指标达到了出院标准，但仍有12%的患者粪便可以持续排毒，提示对于康复期患者仍需加强粪便管理，防止粪口传播。研究发现在病程第7周时仍然有2例患者粪便核酸阳性，但病程7周以上的患者（共筛检303例）的粪便病毒核酸未再检出阳性。（见图1）

图1. 患者粪便中 SARS-CoV-2在病程不同时间（周）的检测情况。

研究同时还收集了粪便病毒核酸阳性的患者配对的呼吸道样本，共517对（同一天采集的粪便和呼吸道样本），结果发现29.8%(111对)的患者粪便病毒RNA检测呈阳性，而呼吸道样本中呈阴性，这表明在呼吸道中病毒被清除后，病毒仍有可能在肠道中复制，仍有可能会发生粪口传播的风险。当两类样本同时阳性时，粪便样本病毒载量普遍较呼吸道样本高，提示对粪便样本的病毒核酸检测，有助于提高新冠病毒感染的阳性率。

研究还发现儿童新冠感染患者粪便的病毒阳性率远高于成人，提示要重视儿童新冠病毒感染患者粪便样本的病毒核酸检测和管理；同时发现胃肠道症状的存在似乎与粪便样本病毒阳性无相关性，提示新冠病毒可能将肠道作为储存和复制的场所，但尚未发现其对肠道功能的严重影响；此外，患者的中性粒细胞水平与病毒在粪便中持续时间呈正相关，而抗病毒治疗启动时间与病毒在粪便中持续时间呈负相关，提示早期有效抗病毒治疗也许能够缩短SARS-CoV-2在肠道存在时间。

解读文献2：Laboratory Diagnosis and Monitoring the Viral Shedding of SARS-CoV-2 Infection

本文由深圳市第三人民医院国家传染病临床研究中心的刘映霞教授团队通过RT-PCR检测分析了不同呼吸道标本，并对比了新冠患者上呼吸道和下呼吸道之间的病毒脱落情况的差异。研究对不同时期、不同样本的病毒载量提供了翔实的研究数据，从而提高了新冠检测的准确性。

样本情况：

本期研究收集了410例患者的3,552份呼吸道标本，包括559份口咽拭子，2,231份鼻咽拭子，696份痰标本和66 份支气管肺泡灌洗液（BALF）样本。在这些患者中，90例为重症患者，320例为轻度和中度患者。

图2. 患者状况分布图

不同呼吸道样本中检测新冠病原体

本期研究对发病后0-7天，8-14天和15天以上三个时间分别进行了采样。文章中的每个样本均采用了上海伯杰医疗科技有限公司的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒（荧光PCR法）进行检测。结果表明，发病0-7天样本中，痰样本的阳性率最高，其次是鼻咽拭子，然后是口咽拭子。在发病8-14天中，痰样本也显示出了最高的阳性率。而在15天以后，几种样本的阳性率基本持平。在0-7天和8-14天两组中，重症患者的支气管肺泡灌洗液的阳性率为100%，但是轻度患者为阴性。15天后，重症患者的支气管肺泡灌洗液的阳性率依旧高达63.8%。并且随着时间的增长，病毒载量和阳性率会逐渐降低。

上，下呼吸道的不同检测结果

实验收集了21名新冠患者的上，下呼吸道样本。在重症患者中，RNA病毒能在大部分上呼吸道样本中被检测到。支气管肺泡灌洗液样本中的RNA病毒最早在第4天被发现，但重症病例的Ct值较低。尽管病毒RNA在部分上呼吸道样本中显阴性，但在支气管肺泡灌洗液样本中会显出阳性。相反，在轻度患者中，仅在上呼吸道检测出了RNA病毒，而未在支气管肺泡灌洗液样本中检测到。

图3. RNA病原体的检测状况

结论：

1.多种样本检测结果互为补充，能够有效防止漏检：根据实验结果，新冠不同疾病程度患者的痰样本、鼻咽拭子、口咽拭子阳性率不同，痰液的检出率相对较高。

2.重症病例上呼吸道样本检出率低，需联合其他辅助手段：经过上，下呼吸道的样本检测，一些重症病例的上呼吸道样本中未检测出病毒RNA但在痰液样本中显示为阳性。由此可见，尽管未在上呼吸道样本中检测到病毒RNA，但不应将那些具有接触史和临床症状的可疑病例排除。在这种情况下，CT扫描可能为诊断COVID-19提供重要证据。

3.下呼吸道病毒脱落时间更长：研究发现，下呼吸道的病毒脱落时间可持续长达46天，这比先前发现的上呼吸道样本的病毒脱落时间更长。在制定治疗和抗击病毒传播的策略时，应谨慎对待新冠病毒的异常病毒脱落情况。

图4. RNA病毒的脱落持续时长

综上所述，两篇文章中均探讨了针对不同样本类型的新冠阳性检出率。痰液的检出率相对较高，但是除呼吸道样本外粪便检测也可以作为呼吸道样本检测很好补充。当下疫情的重点之一，在于筛查出初期及无症状感染者，而多样化的取样送检，可以有效地提高检出率避免漏检。

本文中所提及的学术研究所使用的检测试剂，来自于上海伯杰医疗科技有限公司的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒（荧光PCR法）。此番能够在科研合作中出一份力，伯杰医疗深感荣幸。成立以来，伯杰医疗一直专注于传染性病原体的诊断，秉承“勇于创新，质量为先”的方针。助力检验科研事业的发展，伯杰医疗责无旁贷！

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